Que sont les champignons ? Certains de ces organismes sont trop petits pour être vus à l'œil nu. Certains, comme le rhizomorphes du miel, figurent parmi les plus gros organismes de la planète. Les champignons sont tout autour de nous, dans le pain, dans la bière, et même dans les murs de votre maison. Cette classe diversifiée d’organismes peut survivre presque partout sur la planète Terre. La clé de leur capacité à si bien survivre réside en partie dans leur cycle de vie. Mais que se passe-t-il exactement dans le cycle de vie des champignons ?
Le règne des champignons
Comprendre ‘ce que sont’ les champignons nécessite d’abord de comprendre leur place parmi toutes les formes de vie sur Terre. Historiquement, la biologie s’est basée sur un système de classification développé par le scientifique Robert Whittaker au milieu du XXe siècle. Selon ce système, toute vie est d’abord divisée en procaryotes et eucaryotes – la différence étant que ces derniers possèdent des ‘organites délimités par une membrane’ comme les noyaux et mitochondries. Ensuite, les procaryotes sont divisés en deux règnes, Archaebacteria, et Eubacteria. Un peu plus complexe, les Eukarya sont divisés en quatre règnes, qui vous sembleront bien plus familiers : Protista, Plantae, Animalia, et Fungi. Le schéma ci-dessous vous aidera à visualiser ce dont nous parlons.

Ce système évolue cependant. Depuis le début du XXIe siècle, les biologistes ont commencé à adopter une version plus récente et plus détaillée de l’arbre de la vie. Ce nouveau système divise tous les eucaryotes en six groupes différents. L’un de ces groupes, Opisthokonta, comprend tous les vrais champignons ainsi que nous, Animalia ! Regardez ci-dessous pour comparer ces deux systèmes. Pour nos besoins, nous considérerons tous les champignons comme un seul ‘règne’ puisqu’ils sont toujours classés comme un groupe unique.

Classification des champignons
Les champignons forment un règne extrêmement diversifié. La façon la plus simple de comprendre cette diversité est de les diviser en quatre grands groupes : Chytridiomycota (chytrides), Zygomycota (moisissures du pain), Ascomycota (levures et champignons en sac), et Basidiomycota (champignons en clavaire). Ces divisions sont principalement basées sur leur mode de reproduction, mais nous y reviendrons plus tard. D’abord, examinons ce que chacun de ces groupes implique.
- Chytridiomycota : ces champignons sont souvent considérés comme les champignons les plus primitifs, et sont apparus il y a environ 500 millions d’années. Les chytrides sont uniques dans le monde des champignons car leurs spores (appelées zoospores) sont mobiles. Elles ont souvent un seul flagelle qui les propulse dans des environnements aqueux. Fait intéressant, ces champignons peuvent survivre sans oxygène et se trouvent dans l’intestin des vaches où ils décomposent la matière végétale.
- Zygomycota : ce groupe de champignons est un que vous pouvez rencontrer régulièrement dans la vie quotidienne. Ce sont l’une des moisissures alimentaires les plus communes que vous pouvez voir sur des aliments avariés comme les fraises, par exemple. Zygomycota représentent environ 1 % de toutes les espèces de champignons.
- Ascomycota : ces champignons représentent la grande majorité des espèces de champignons, environ 75 %. Ils sont responsables de nombreuses fonctions très importantes et intéressantes. Saccharomyces cerevisiae est la levure communément associée à la fabrication de la bière et à la boulangerie. Penicillium chrysogenum a donné son nom à l’antibiotique salvateur. Ce sont également les champignons que vous pouvez voir en relation symbiotique avec des algues sous la forme de lichen.
- Basidiomycota : bien que vous ne le sachiez peut-être pas, vous avez probablement déjà mangé un membre des Basidiomycota ! Ce groupe de champignons comprend presque tous les champignons. Ces champignons ne représentent en réalité qu’une seule partie du cycle de vie de l’organisme. Ces champignons jouent un rôle crucial car ils décomposent la matière en décomposition, comme le bois et les plantes, et permettent aux nutriments de retourner dans le sol.

Cycle de vie sexué des champignons
Tous les champignons ne se reproduisent pas de la même manière. De manière générale, ils se reproduisent soit sexuellement, soit asexuellement. En biologie, la définition de ‘reproduction sexuelle’ peut différer du sens courant. La ‘reproduction sexuelle’ signifie simplement que l’information génétique de deux individus se combine pour former un individu. Commençons par les cycles de vie des champignons impliquant une reproduction sexuelle.
Sexué
La première phase du cycle de vie des champignons est la phase de spore. Tous les champignons commencent comme des spores qui sont ‘haploïdes’, c’est-à-dire qu’elles ont une seule copie de toutes leurs informations génétiques. C’est similaire aux cellules sexuelles humaines, comme les spermatozoïdes et les ovules. Ces spores peuvent voyager sur de vastes distances depuis leur lieu de production en s’attachant à un autre organisme ou même portées par le vent. Une fois la spore déposée dans un environnement favorable, elle germe et développe une masse de ‘racines’ appelée mycélium. Ces racines soutiennent la spore de la même manière que des racines en trouvant les nutriments nécessaires à la croissance des spores.
À mesure que le mycélium grandit, il peut rencontrer un autre champignon compatible. Si cela se produit, les cellules de chaque champignon peuvent fusionner pour former une seule cellule. Ces cellules fusionnées sont maintenant ‘diploïdes’, ce qui signifie qu’elles ont deux copies de toutes leurs informations génétiques. C’est comme toutes les autres cellules humaines qui ne sont pas sexuelles.
Ces cellules subissent alors un processus appelé ‘méiose’. C’est lorsque une cellule se divise en deux cellules. Il est important de noter que durant cette division, l’information génétique de chaque parent est mélangée. Les deux cellules ‘filles’ résultantes ne sont donc identiques ni à leurs parents ni l’une à l’autre. C’est ainsi que les champignons (et tous les organismes à reproduction sexuelle) maintiennent leur diversité génétique.
Asexué
Au stade du mycélium, la plupart des champignons peuvent aussi ‘choisir’ de se reproduire asexuellement. Cette décision dépend de nombreux facteurs environnementaux comme la disponibilité des ressources et l’humidité. Dans cette partie du cycle de vie, au lieu de croître et de se combiner avec un autre mycélium, le champignon produit des ‘mitospores’ identiques au parent. Ces mitospores développent alors un nouveau mycélium. Si les conditions sont favorables, ce mycélium peut ensuite réaliser une reproduction sexuelle.
Cycle de vie complexe
Les champignons forment un groupe extrêmement divers et complexe d’organismes. Bien que nous venions de commencer à effleurer la surface des nombreux cycles de vie complexes des champignons, ces principes de base s’appliquent à la plupart d’entre eux. La prochaine fois que vous ouvrirez un sac de pain moisi, pensez au cycle de vie des champignons que vous voyez !

